Соята е слаб конкурент на плевелите, особенно в началните фази от развитието си, което оказва отрицателно влияние върху добива. Широко разпространени са едногодишните широколистни видове: черно куче грозде, свиница, татул, а от многогодишните: балур, повитица, паламида.
Добра практика в борбата срещу плевелите при соята е прилагането на агротехнически и химически мероприятия. От съществено значение е засяването на соята след житни със слята повърхност. Обработката на почвата да бъде съобразена с почвения тип, характера и степента на заплевеляване. Навременното и качествено извършване на основната оран има решаващо значение за ограничаване заплевеляването с многогодишни коренищни и кореновоиздънкови плевели. Поникналите след това издънки могат да бъдат унищожени чрез подходящи хербициди. Допълнителните есенни и пролетни предсеитбени обработки са ефективни за унищожаване на едногодишните плевели.
Соята е култура, която пониква бавно особено при студени и влажни условия и плевелите често поникват преди нея. В този случай борбата срещу тях се извършва чрез брануване преди поникването на соевите растения. Прилага се механичната борба чрез окопаване, като броят на обработките зависи от степентта на заплевеляване и уплътняването на почвата.
Химичните третирания са в зависимост от: наличието на плевелни семена в почвата преди поникване на соята, видовия състав и степента на заплевеляване след поникване на културата, климатичните и почвените условия, определящи ефективността на продукти за растителна защита. В края на вегетацията се извършва десикация на плевелите.
Ефективната борба с плевелите в соята се води, като се използват препарати за растителна защита със следните акгивни вещества:
Преди поникване:
- преди сеитба-срещу едногодишни, житни и широколистни видове: трифлуралин (с инкорпориране, почвено)
- след сеитба-срещу едногодишни, широколистни видове: линурон, прометрин, оксифлуорфен, метрибузин, метобромурон
- (почвено); срещу едногодишни широколистни и преобладаващи едногодишни житни видове: ацетохлор, метолахлор, алахлор, пропизахлор, пендиметалин, диметанамид (почвено).
След поникване:
-срещу едногодишни, широколистни видове: бентазон, фомезафен (вегетационно); срещу едногодишни и многогодишни житни видове: флуазифоп-П-бутил, пропакфизафоп, халоксифоп, сетоксидим, квизалофоп-П-тефурил, клетодим, квизалофоп-П-етил, циклок-сидим, феноксапроп-П-етил (вегетационнно).
Десиканти: глифозат, дикват (вегетационно).