Обеззаразяването на почвата с базамид гранулат трябва да става в сутрешните часове на деня, когато температурата на въздуха и почвата е все още ниска. Когато температурата се повиши през деня, количеството на излитащия от гранулите газ силно нараства. Това от една страна, води до намаляване на ефекта, а от друга, до обгазяване на средата, където се работи за смесване на препарата с почвата. Смесването трябва да се извършва непосредствено след разпръскването, като по възможност двете практики трябва да се извършват едновременно.
При обеззаразяване с базамид гранулат почвата трябва предварително да се очисти от растителните остатъци, като кореновата система на растенията. Необходима му е влажна почва, за да се разложи на метилизотиоцианат, формалдехид, метиламин, сероводород. Отделените газове се разпространяват във всички посоки в почвата и унищожават всички живи организми, които се намират в нея. Продуктът е ефикасен срещу нематоди – галови и цистообразуващи; почвени патогенни гъби – Pythium, Phytophthora, Verticillium, Fusarium, Rhizoctonia, Pyrenochaeta, Phoma, Didymella и др.; почвени неприятели – ларви на телени червеи, нощенки, майски бръмбари и др.; плевели – коприва, поа, овчарска торбичка, лобода, звездица, кръвно просо, кощрява, черно куче грозде и др.
Освен това, за да получим по-добър ефект от обеззаразяването на почвата с базамид гранулат, една седмица преди третирането почвата трябва да се навлажни до 70-75% от ППВ. Почвата трябва да бъде влажна и по време на самото внасяне на препарата. Когато почвата е суха резултатите от обеззаразяването с базамид гранулат са лоши. Най-добре е след фрезуването почвата да се покрие веднага с полиетиленово фолио. Когато не е възможно да се покрие, излитането на препарата във въздуха се предотвратява, чрез неколкократно оросяване на повърхността на почвата с вода за 2-3 мин.